市卫生局设5个职能科(室)：

　　(一)办公室

　　负责综合协调、会议组织、文电收发处理、信息收集、文书档案整理归档、保密、安全保卫、社会治安综合管理和群众来信、来访、接待等工作;制订局机关各项工作制度，协调和督办各科室的业务工作;负责局机关和直属单位的机构编制，人事调配、考核、使用、劳动工资、卫生专业技术职务资格评审等工作。负责编制全市卫生事业发展总体规划、目标、中长期规划和年度计划并组织实施;拟订全市卫生财务管理制度及各项财务管理办法，对全市卫生财务工作进行业务指导;协助价格主管部门制订卫生服务收费标准，研究提出卫生服务价格建议，负责宏观指导和监督管理全市医疗卫生服务价格收费标准;根据卫生发展规划和政策，协调有关部门争取落实卫生事业发展的有关物质条件;对全市各级各类卫生机构实行综合效益评价;对局机关财务、基建、资产等进行管理;对局属卫生单位的计划、财务、基建、国有资产等进行监督管理;负责辖区大型医疗设备规划的报批，指导监督卫生专项经费和医疗设备经费的使用，组织指导本系统内部审计业务，协调全市卫生信息网络系统建设和负责卫生统计工作。

　　(二)医政科

　　制订全市医疗业务的发展规划和医疗机构管理方案，并实施监督管理;负责制订全市城乡各级各类医疗、疗养、康复、保健的规划与办法，并负责协调、组织实施，指导和评估;负责医疗急救网的建设和管理，协助下级政府和有关部门对重大灾害事故和重大人员伤亡事故实施紧急救护;负责全市输血工作管理;负责全市医疗事故鉴定的组织、调查工作和医师、护士执业注册管理;负责中等医学教育、成人卫生教育、继续医学教育以及社会力量办医学类学校进行监督管理和业务指导;负责中医管理工作;负责城乡个体行医、社会办医和医疗广告的管理。

　　(三)防保科

　　负责贯彻执行国家劳动、食品、学校、环境、放射卫生及化妆保健品卫生等法律、法规、规章和卫生标准及防治规划，并监督实施;贯彻执行国家传染病防治法律、法规，制订全市鼠疫、霍乱、伤寒、痢疾、乙脑、流脑、麻风病、性病、结核病等传染病、地方病、寄生虫病以及其他严重危害人体健康疾病的防治规划和预案，并指导实施和进行监督检查。认真组织落实计划免疫工作，进一步巩固计免成果。遇有重大疫情和自然灾害，组织全市卫生技术力量，协助下级政府和有关部门控制疾病的发生、蔓延;对全市卫生监督监测机构、疾病控制机构和其他专业防病机构进行业务指导;协调有关部门做好卫生宣传与健康教育，普及卫生知识，组织协调有关部门和各级政府做好防治工作和监督指导工作;负责贯彻母婴保健法律、法规，制订全市妇幼卫生、优生优育工作的发展规划和目标，并组织实施;负责全市各级妇幼保健机构的建设和目标管理;负责有关技术服务的质量监督和业务指导，组织防治危害妇女、儿童健康的常见病、多发病;开展妇幼卫生健康教育工作。

　　(四)卫生法规和监督科

　　根据国家有关规定履行卫生综合执法职能;负责本级卫生行政复议和行政应诉工作。负责卫生行政处罚的审查、听政和决定;负责卫生行政赔偿的审核;负责对卫生执法、卫生执法机构、卫生执法人员的监督和管理;组织协调全市卫生系统普法及依法治理工作。

　　(五)市爱国卫生运动委员会办公室

　　贯彻落实国家爱国卫生运动委员会颁发的法规、规章;统筹协调落实市各委员部门分担的工作任务;组织开展城乡社会性公共卫生管理、监督、检查、评比活动;负责协调开展健康教育工作、普及卫生科学知识;协调社会各有关部门和群众参与爱国卫生运动。组织指导农村改水、改厕工作。做好除“四害”药械的供销和监督管理工作。