在国家863、973专项经费和国家自然科学基金创新研究群体科学基金资助下，我院所分子肿瘤学国家重点实验室和病因及癌变研究室与南京医科大学、中山大学肿瘤防治中心、北京市肿瘤防治研究所、华中科技大学同济医学院和美国国立癌症研究院(NCI)等国内外多家单位合作开展的食管癌全基因关联研究再获重要成果。一篇题为“Genome-wide　association　analyses　of　esophageal　squamous　cell　carcinoma　in　Chinese　identify　multiple　susceptibility　loci　and　gene-environment　interactions”　的研究论文于2012年9月9日在线发表在国际著名期刊《Nature　Genetics》。

　　该研究运用高密度SNP芯片，在全基因组范围检测了大样本量的食管癌患者和正常对照者的基因变异，并经过多中心、大样本量的病例-对照验证，发现5个染色体区段的7个变异(5q11的rs10052657，21q22的rs2014300，6p21的　rs10484761，10q23的rs2274223和12q24的rs11066015、rs2074356和rs11066280)与食管癌发病相关。虽然全基因组关联研究已经发现若干食管癌的易感位点，但这些位点还不足以解释食管癌的总遗传度。因此，在上述研究结果的基础上，林东昕教授带领团队继续在食管癌GWAS数据中挑选10-7<　P?10-4的169个SNP，用Illumina　的Goldengate芯片进行二期验证。在由8092食管癌病例和8620对照组成的两期验证队列中，又发现9个食管癌易感位点，其中7个位点(4q23,　16q12.1,　17q21,　22q12,　3q27,　17p13　and　18p11)显示显著的边际效用，而另外两个位点(2q22　and　13q33)则只在饮酒加入分析后才显示其作用。发现位于染色体4q23的易感位点是代谢酒精的乙醇脱氢酶家族(ADHs)基因所在的区域，这些位点的变异与饮酒有显著的交互作用。此外，应用全基因组基因-环境交互作用分析方法，还重复验证出含乙醛脱氢酶基因(ALDH2)的12q24位点与饮酒的交互作用。联合分析发现，携带ADH1B和ALDH2危险等位基因者如果饮酒，发生食管癌的风险比携带非危险等位基因的4倍，而如果不饮酒，即使携带ADH1B和ALDH2危险等位基因发生食管癌的风险也很小。这些结果十分清楚地显示酒精代谢通路的基因变异与饮酒在食管癌病因中起重要作用。

　　目前这项研究共发现食管癌12个新的遗传易感位点，分布于多个染色体区域。这些基因变异对增加食管癌的风险有累加作用，其中有的与吸烟和饮酒有显著的基因——环境交互作用。这些结果揭示了食管癌的发生涉及多基因以及基因与环境之间的交互作用，对理解食管癌发生发展的分子机理、对食管癌预警和早期诊断、预防都有重要的意义。此项研究成果是国内外多家学术单位共同合作的结果，也凝聚着我院所林东昕教授课题组、詹启敏教授课题组和刘芝华教授课题组的诸多努力;吴晨、翟侃、常江等多名博士研究生参与该研究，为完成该研究做出重要贡献。　(分子肿瘤学国家重点实验室、病因及癌变研究室　谭文)